Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms