Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrna9G3X8Z7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna9G3X8Z7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms