Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Farp1F8VPU2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms