Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms