Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28048F7BCN0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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