Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms