Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms