Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmod3E9QA62 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms