Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms