Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC005561E9Q5E2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms