Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DspE9Q557 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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