Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CenpfE9Q3P4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms