Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r238E9Q373 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r238E9Q373 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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