Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tarbp1E9Q368 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms