Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
6430550D23RikE9Q1X6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms