Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms