Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc1E9Q043 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms