Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms