Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd1E9PZ26 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd1E9PZ26 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms