Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU018091E9PWS4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms