Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clca3bE9PUL3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms