Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms