Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms