Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rexo5D3YW29 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo5D3YW29 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms