Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.2 ms