Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms