Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms