Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip3B9EHT4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip3B9EHT4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms