Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm20547B8JJN0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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