Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms