Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah3B2RWG3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms