Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clrn2B2RVW2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms