Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms