Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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