Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms