Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Zbed5B2RPU8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Zbed5B2RPU8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Zbed5B2RPU8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Zbed5B2RPU8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Zbed5B2RPU8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed5B2RPU8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms