Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prr16A3KMN5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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