Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms