Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms