Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtf1A2AQ19 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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