Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Lcn6A2AJB9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms