Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms