Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms