Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms