Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms