Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms