Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms