Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssc4dA1L0T3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms