Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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NIPSNAP3AQ9UFN0 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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NIPSNAP3AQ9UFN0 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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