Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FHL3Q13643 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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FHL3Q13643 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
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FHL3Q13643 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FHL3Q13643 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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FHL3Q13643 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
FHL3Q13643 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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